Slow Step!

GPM은 무료로, LC-MS를 통해 얻어진 MS/MS 데이터를 분석해주는 소프트웨어로서, 인터넷으로 파일을 업로드 해서 분석하거나 아니면 직접 소프트웨어를 자신의 컴퓨터에 설치해서 사용할 수도 있다.
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GPM을 본인의 컴퓨터에 설치하는 방법

1. 기본적인 설치 과정은 아래의 instruction 참고
    http://www.thegpm.org/GPM/instructions.html

2. 1번의 과정대로 따라가다가 7번과 8번의 경우, 자신의 컴퓨터의 apache 폴더 밑에 conf라는 폴더를 보면 httpd.conf 라는 파일이 있다. 그 파일을 메모장 등으로 열어서 다음의 두 가지를 바꿔주거나 추가해 주면 된다.

    DocumentRoot C:\APM_Setup\Server\Apache\htdocs\thegpm
    ScriptAlias /thegpm-cgi/ "C:\APM_Setup\Server\Apache/htdocs/thegpm/thegpm-cgi/"


3. 그런다음, 자신이 원하는, fasta 포맷으로 된, protein sequence를 구한다음 그것을 fasta 폴더 밑에 넣어둔다.

4. tandem 폴더 아래에 있는 taxonomy.xml 이라는 파일을 메모장으로 연 다음, 3번에서 추가된 fasta 파일의 정보를 넣어준다.

5. tandem 폴더 아래에 있는 species.js 라는 파일을 메모장으로 연 다음, 3번에서 추가된 fasta 파일의 정보를 넣어준다.